在毕业时，如果发现毕业证书的封皮损坏，可以采取几种方法进行补救。首先，如果损坏程度不是特别严重，可以尝试使用热熔胶等粘合剂进行修补。因为毕业证书的核心内容在于其内部，封皮只是外在形式，因此即便封皮有瑕疵，也不影响证书的实际效力。

然而，若损坏情况较为严重，可能需要向原毕业学校申请重新领取封皮。通常情况下，学校会提供重新领取服务，学生只需向学校相关部门提出申请，并说明封皮损坏的情况。学校审核通过后，会邮寄新的封皮给申请者。

值得注意的是，无论选择哪种补救方式，都应尽早采取行动，以避免因证书外观问题带来的不便。如果未能及时处理，可能会影响到日后的工作求职、升学深造等重要事项。

此外，如果在申请补发过程中遇到任何问题，建议直接联系学校的相关部门，获取详细的处理流程和所需材料，以确保顺利解决问题。