银行存款在借方填付款凭证。

详细解释如下：

银行存款在借方表示资金进入账户，是一种增加账户余额的行为。为了记录这一操作，会计需要填写相应的凭证。在这种情况下，应使用付款凭证。

付款凭证的定义是，在企业和外部单位或个人之间发生资金流动时，由企业向外部单位或个人支付款项的凭证。当银行存款在借方增加时，意味着企业账户向外支付款项，因此应填写付款凭证。这种凭证详细记录了付款的日期、金额、账户号以及对方单位或个人的信息等重要内容。

在实际操作过程中，会计需确保正确填写付款凭证的各项内容，特别是金额和账户信息，以保证账务的准确性。此外，填写完毕后还需进行严格的审核，确保凭证的合法性和规范性，以保障企业的资金安全。

总之，对于银行存款在借方的情况，会计应填写付款凭证来记录这一资金流动情况，确保企业账务的准确性和资金的安全性。