5年内到当地注册会计师协会办理注册就不会作废。根据查询高频网显示，注册会计师全科合格证有效期是永久的，但根据规定，取得注册会计师全科考试合格证后，要在5年之内到所在地的注册会计师协会办理注册，过期不办，全科合格证就作废。所以注会全科合格证在5年内到当地的注册会计师协会办理注册是不会作废的。