我不知道你的日语什么水平，在意义上来讲是没有区别的。

简单来说，只是在某些特定的词组会使用特定的词。

比如说中日文化比较：日中文化対照

文化冲击：カルチャーショック

直观上来看，这两个词在单独使用（只表示文化）的情况下，可以通用。

比如说“非洲某些地方有奇怪的文化”

アフリカのある地域には変な文化（カルチャー）がある。

但是在外来语复合词时使用カルチャー，而在汉字复合词的时候用ぶんか。

当你有了一定的语感，其中的细节也会更清楚，如果只是学习的话，上面的记法足够了。