西昌学院拥有丰富的专业设置，涵盖了本科和专科两个层次。本科专业共有53个，包括电子信息工程、轻化工程、计算机科学与技术、机械设计制造及其自动化、纺织工程、应用化工技术、自动化、生物工程、食品药品监督管理、通信工程、金属材料工程、电子科学与技术、城市规划、烟草栽培技术、电气工程及其自动化、电气工程与自动化、食品质量与安全、水利水电工程、土木工程、食品科学与工程、动物医学、建筑环境与设备工程、动物科学、水产养殖学、化学工程与工艺、野生动物与自然保护区管理、农学、工业工程、生物科学、园艺、英语、工程管理、中国少数民族语言文学(彝汉双语)、财务管理、思想政治教育、电子商务、美术学、体育教育、广播电视新闻学、工商管理、小学教育、汉语言文学、市场营销、中国少数民族语言文学、应用心理学、资源环境与城乡规划管理、土地资源管理、化学、旅游管理、行政管理、数学与应用数学、数学与应用数学(职教师资)、物理学等。

专科专业共有18个，包括园林技术、生物教育、物流管理、计算机网络技术、彝汉双语教育(化学)、物业管理、电脑艺术设计、人力资源管理、彝汉双语教育(英语)、法律事务、初等教育、社会体育、建筑工程技术、英语教育、音乐教育、应用电子技术、汽车电子技术、语文教育。

此外，西昌学院还设有5个其他专业，分别是汽车服务工程、材料科学与工程、烟草、农村区域发展、国际经济与贸易。

这些专业的设置充分体现了西昌学院对人才培养和学科建设的高度重视，为学生提供了多元化的学习和发展机会。