发票丢失是企业日常运营中可能遇到的情况，处理方式需遵循以下步骤，确保合法合规。

首先，发票丢失者需向当地公安部门报案，以证明发票确实丢失。报案的目的在于后续寻找丢失发票或防止他人冒用。公安部门会出具发票遗失证明，此证明对后续流程至关重要。

接着，携带公安部门受理报案的回执单和登报声明的草稿，至所属税务机关进行发票挂失。税务机关会核实信息，并指导挂失流程，确保发票的有效性得到维护。

在税务机关的指示下，丢失人需进行发票的登报声明。对于增值税专用发票，声明将通过《中国税务报》进行，而普通发票的声明则需在本地新闻媒介进行。此步骤旨在公开声明发票作废，防止他人利用丢失发票进行非法活动。

完成登报声明后，丢失人需持登报的刊物原件和其他资料至税务机关发票管理岗。税务机关将开具《纳税证明书》，此证明书具有证明发票已丢失和纳税人已履行纳税义务的功能，有助于合法入账。

在处理过程中，税务机关可能会根据情况对发票丢失行为进行罚款。丢失者需按要求缴纳罚款。

针对开具方丢失的空白发票，除了上述流程外，还需在税控系统中进行空白发票作废操作。税控系统中与纸质发票一一对应且有顺序编号，若丢失的发票尚未开具，需将系统中的对应“未开发票”也一并作废。系统操作需按编号顺序进行，如丢失的发票是下一张要开具的，直接作废即可；若丢失的是后续的发票，需等待前面的发票开具完成，系统才能执行作废操作。