你好，不知道你讲的是什么工程，如果是道路工程对于因地质原因需要超深开挖的可以单独计算这部分超挖及回填量，以变更或洽商签证的形式单独计量，对于上部正常开挖部分可以按正常程序来计算计量。

给你推荐一个计算道路工程土方的软件：《易算土方戴帽宝》或《易算土方》，官网有详细教学视频，可以下载看一下。