处理应付佣金与佣金支出的核对问题，首要步骤在于清晰的账目管理。将佣金单独设为一个明细科目，如“其他应付款—佣金—张三”，便于具体追踪和审核。

每月进行佣金计提时，应借记“管理费用”科目，贷记“其他应付款—佣金—张三”科目。这一步骤确保了在费用发生时，对应的应付佣金已预先记录在账上。

当实际支付佣金时，则需执行相反的会计操作。借记“其他应付款—佣金—张三”科目，贷记“库存现金”科目。此举标志着从应付状态转变为实际支付，保证了财务记录的准确性和完整性。

通过此流程，不仅能够清晰地反映佣金的应计和实际支付情况，还便于定期进行核对，确保账目无误，避免潜在的错误或遗漏。这种细致入微的财务处理方法，对于企业管理和控制成本、提升透明度具有重要意义。