增值税专用发票认证后抵扣，理论上不允许作废。根据国家税务总局规定，销货方需收集齐发票所有联次，才能执行作废操作。若未收集齐联次而直接作废，将视为未按规定操作，主管国税局将给予处罚。

实际情况中，由于复杂原因，销货方在未收集齐发票所有联次的情况下可能进行了作废操作。这种情况下，购方在当月可能需要被动进行进项税额转出。

发票认证抵扣后，原则上不支持作废。按照国家税务总局要求，销货方完成作废操作需确保获取发票所有联次。若在未收集齐联次的情况下进行作废，可能面临主管国税局的处罚。

现实中，销货方在未获取所有联次的情况下仍可能执行作废操作，导致购方在当月需要进行进项税额转出。这种非标准操作，可能引发税务合规风险。