当工程款用于抵扣房产时，会计入账的步骤如下：

首先，您收到工程款时，需要向对方开具发票。

其次，当对方用房产抵扣您的工程款时，应向您开具销售不动产的发票。

这一过程虽然涉及无现金交易，但通过两个清晰的会计分录，可以明确资金流向。

在会计分录方面，您应当这样记录：

借方：固定资产—房产

贷方：主营业务收入—工程款

同时，您收到的工程款还需要缴纳相应的营业税等税费。会计分录可以这样处理：

借：银行存款

贷：预收账款—房款—具体项目

对于房地产企业而言，在收到预售房款时，由于不符合收入确认条件，不会立即确认收入，但需要按税法规定缴纳营业税和企业所得税。因此，会计处理应如下：

借：银行存款

贷：预收账款

期末计算应缴纳的税费时：

借：应交税费—应交营业税等

贷：银行存款

当客户支付全部房款时，会计应确认收入，同时开具发票：

借：银行存款

借：预收账款

借：营业税金及附加

贷：主营业务收入

贷：应交税费—应交营业税等

此时，税金账户已经平衡。

需要注意的是，会计收入确认不应仅以开发票为标准，而税务局应关注企业是否按时足额缴纳了税款，不应干预会计确认的时间和方法。