根据会计法的规定，自行开发并依法申请取得的专利，其申请费用应当计入无形资产的实际成本中。在研发过程中产生的材料费用、直接参与开发人员的工资及福利等，则应直接计入当期损益。

具体操作上，首先，出纳需提交各种原始凭证，会计对其进行审核确认无误后，编制相应的记账凭证。

其次，依据记账凭证，会计需登记各类明细分类账，以便准确记录每笔交易。

月末时，会计还需编制计提、摊销及结转的记账凭证，对所有记账凭证进行汇总，形成记账凭证汇总表，再根据汇总表登记总账。

完成账目后，还需进行结账、对账工作，确保账证相符、账账相符、账实相符。

之后，会计需编制财务报表，确保数据准确、内容完整，并进行详细的分析说明。

最后，所有记账凭证需整理装订成册，妥善保管，以备日后查阅。

值得注意的是，专利申请过程中产生的费用，必须及时记录并准确入账，以确保财务数据的真实性和准确性。

在实际操作中，如果遇到费用分类不清或金额计算有误的情况，应及时与相关部门沟通确认，确保费用入账的正确性。

此外，为了保证财务数据的连续性和一致性，建议定期进行账目核对和财务审计，及时发现并纠正可能存在的问题。

通过规范的账务处理流程，可以有效提升企业的财务管理水平，为企业决策提供可靠的财务依据。