小规模纳税人零申报流程包括国税报税与地税报税两个方面。国税报税流程如下：每月需进行电话申报，并填写小规模增值税申报表，此表一式三份，每季度报一次。所得税申报时间一般为1月、4月、7月、10月15日之前，与所得税一同提交。地税报税流程为：每月需报城建税、教育附加费及个人所得税，其中残疾人保障金、价格调节基金、防洪基金等税费通常每年交纳一次。工会经费的缴纳则需视实际情况而定。如企业无业务，报表中只需填写零申报即可。