发票金额多开且已被对方认证的情况下，需迅速与对方沟通，要求对方将已认证的发票退回，重新开具正确的发票。若对方已认证无法退回，应在当月将原发票作废，并重新开具正确的发票。对方公司应将已认证作废的发票税金进行进项税额转出处理，具体操作需在月初申报时完成。若未能及时处理，隔月将增加处理的复杂性。

操作时应注意，对方退回原发票并重新开具正确发票后，应及时通知财务部门进行账务调整。如对方无法退回已认证的发票，需按照规定流程进行作废和重开，确保账务数据准确无误。月末进行财务对账时，需特别关注此类发票的处理情况，确保账务一致性和准确性。

此外，企业应建立完善的发票管理制度，加强与客户的沟通，避免类似问题的发生。对于多开的发票，企业应及时发现并处理，防止因处理不及时而增加财务负担。在日常工作中，企业还需定期检查发票管理流程，确保流程规范、操作准确，以提高工作效率和减少财务风险。

在处理多开的发票时，企业还应密切关注税务政策的变化，确保账务处理符合最新规定。对于无法退回的已认证发票，企业需严格按照税务机关的要求进行进项税额转出，避免因处理不当而产生税务风险。

综上所述，企业在处理发票多开问题时，需迅速与对方沟通，确保及时退回或作废原发票，并重新开具正确的发票。同时，企业还需建立完善的发票管理制度，加强与客户的沟通，确保账务处理准确无误，避免因处理不当而增加财务负担或产生税务风险。