处理学历证书电子备案表过期的方法是：

1、联系相关教育部门或学校，了解更新学历证书电子备案表的具体要求和流程

2、准备学历证书电子备案表过期所需的材料，如身份证明、学历证书复印件等，并按要求填写申请表格。

3、提交申请材料并等待审批结果以更新学历证书电子备案表的有效期。