卤水储存需注意清洁，每次卤完菜品后，应用纱布过滤掉卤水中的肉末等杂质，以减少变质的可能性。

无论是否使用卤水，应每日烧开一次，保持卤水的热度，并确保卤水通风，可将卤桶垫高，以促进快速降温。

为防止细菌污染，卤水表面应保留3厘米厚的卤油，隔绝与空气直接接触。

卤水中适量的盐分具有天然防腐效果，因此应保持一定的盐含量，如感觉卤水过咸，可适量加入老汤或清水稀释。

每次卤肉前，需撇去卤油下的血沫，每隔3天左右，可用清水清洗卤水，通过大火烧开后倒入凉水，血沫会浮出，及时撇除。

若非商用，仅用于家庭卤菜，可将卤水冷却后放入冰箱保存，使用时再取出。