1、首先，企业如果发现发票多开，必须及时处理。发票是企业缴税的依据，因此多开发票将导致企业多缴相应的税款，给企业带来损失。同时，对于虚开发票等违法行为，国家一贯严厉查处，因此，尽管企业并非主动多开发票，也可能面临一定的税务风险。

2、当企业发现多开发票时，如果尚未跨月，那么企业需要求对方配合，及时收回所有发票联次，在当月作废发票，再按照正确的金额重新开具发票。

3、如果企业跨月发现多开发票时，相应的发票及税款已经抄税申报，那么企业就不能直接作废发票，一般情况下，需要开具红字发票将原发票冲销，再按照正确金额重新开具发票。

4、在开具红字发票时，企业必须执行税务机关规定的操作流程，特别是增值税专用发票，执行条件与步骤相对严格，企业要特别注意。

综上所述，企业发生问题，要立即跟进与处理。同时，建议企业在开具发票之前，做好双方的对账工作，将账务核对一致后，再进行开票。