重庆市长寿区旅游局的机构设置包含了多个职能科室，以确保工作的高效进行。综合科主要负责机关内部的干部人事管理、统计分析、安全保密、网络信息管理以及固定资产的资产管理。同时，他们还指导旅游行业的精神文明建设，监管假日旅游，处理财务统计，并负责旅游资源的普查、规划与整合。此外，综合科还负责制定旅游休闲度假方案，整体形象宣传计划，旅游市场开发策略，推动旅游产业结构调整，促进区域间的旅游交流与合作，并负责旅游经济运行的监测、统计及行业信息发布。

行业管理科承担着更为具体的业务指导工作。他们致力于旅游业法律法规的执行和相关标准的实施，包括国家和行业标准。科室的核心任务包括编制和修订全区旅游发展规划，保障市场秩序和旅游服务质量。他们规范旅游企业的经营和服务行为，处理旅游投诉，对三星级以下（含三星）饭店和1A、2A景区进行评定和复核。对于旅行社，行业管理科负责监管，并制定人才开发规划，指导职业培训、旅游项目策划等工作。同时，他们也致力于特色旅游商品的开发和营销工作，以提升旅游业的整体竞争力。