深圳大学的招生情况较为特殊，部分专业在一本批次招生，但大部分专业仍然在二本批次。相比之下，广东外语外贸大学和暨南大学则全部在一本批次招生。

暨南大学作为一所国家211工程重点大学，其整体实力更为突出。而广东外语外贸大学虽然未被纳入211工程，但其外语类学科实力非常强劲。

对于日语专业而言，尽管深圳大学也有设立，但在招生批次上的劣势可能会对其吸引力产生一定影响。广东外语外贸大学和暨南大学在日语专业上的教学资源和师资力量都较为丰富，尤其是在外语类学科方面。

值得一提的是，日语专业的研究生教育在两所学校中都占有重要地位。广东外语外贸大学的日语专业在语言教学和研究方面有着深厚的基础，而暨南大学的日语专业则在跨文化交际和语言应用方面有着独特的优势。

综合来看，无论是从招生批次、学校整体实力还是外语类学科的专业深度上，广东外语外贸大学和暨南大学在日语专业研究生教育方面都具有明显优势。

因此，如果学生希望在日语专业研究生阶段获得更加全面和深入的学习体验，选择广东外语外贸大学或暨南大学将是一个更为理想的选择。