专用发票用第二联抵扣联认证。

详细解释如下：

专用发票是企业在购销业务中开具的，用于证明交易内容并可作为付款及报销凭证的法定票据。在专用发票的几联中，第二联是抵扣联，这一联是专门用于认证和抵扣税款的。

在税务处理过程中，抵扣联的作用是证明纳税人购进货物或服务的增值税专用发票可以用于抵扣税款。认证是指税务部门对发票的真实性和合法性进行核实的过程。通过认证，确保发票是真实有效的，并且符合相关税务规定，这样才能进行税款的抵扣。因此，企业在使用专用发票进行税款抵扣时，必须使用第二联抵扣联进行认证。

具体认证过程通常是由企业的财务部门负责，他们会将抵扣联提交给税务部门或相关的认证机构进行认证。认证通过后，企业才能根据发票内容进行相应的税款抵扣。这样做不仅保障了企业的合法权益，也确保了国家税收的准确性和规范性。所以，对于专用发票的认证问题，企业必须严格按照规定使用第二联抵扣联进行。