医学院最好的大学有北京协和医学院、首都医科大学、南京医科大学、南方医科大学、哈尔滨医科大学。

1、北京协和医学院

北京协和医学院，是国家卫生健康委员会直属、与中国医学科学院实行院校合一管理体制的全国重点大学，国家“双一流”建设高校，入选卓越医生教育培养计划、医学“双一流”建设联盟成员。前身是美英基督教教会于1906年共同创办的协和医学堂。

2、首都医科大学

学校建于1960年，原名北京第二医学院。是北京市重点高等院校，是北京市政府、国家卫生健康委员会、教育部共建院校。入选国家首批“卓越医生教育培养计划”试点高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、国家建设高水平大学公派研究生项目等。

3、南京医科大学

南京医科大学是国家“双一流”建设高校，首批教育部、国家卫生健康委与江苏省人民政府共建医学院校，教育部高水平公共卫生学院建设高校，江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院。

4、南方医科大学

是全国首批、广东省唯一一所“部委省”共建的全国重点大学，全国首批开设八年制本硕博连读临床医学专业的8所高校之一，是广东省高水平大学重点建设高校中唯一的医学院校，全国首批卓越医生、卓越医生教育培养计划试点高校。

5、哈尔滨医科大学

哈尔滨医科大学，简称“哈医大”。是一所历史文化底蕴深厚的医学高等学府学校是部委省共建大学、黑龙江省国内一流大学建设高校、中俄医科大学联盟中方牵头单位、国家理科基础科学研究与教学人才培养基地、教育部首批试办七年制高等医学教育院校等。