日本距离中国最近的城市是大连市。

大连市位于中国东北地区的南端，与日本本州岛隔海相望，两地之间的距离非常近，最近的地方仅有不到100公里的海上距离。大连与日本的地理位置使得两地之间的交通和贸易往来非常便利，也促进了中日两国在经济、文化等领域的交流与合作。

除了大连市，中国沿海地区的一些城市如上海、天津、青岛等也与日本较为接近。然而，由于大连市与日本之间的海上距离最短，且两地之间已经建立了较为完善的交通网络，因此可以说大连市是日本距离中国最近的城市。

此外，值得注意的是，虽然大连市与日本距离较近，但两国之间的政治和安全关系仍然复杂。因此，在涉及国际事务和地区安全等问题时，需要综合考虑多种因素，以维护和平与稳定。