两者最大的区别便是：

1、笛子是需要笛膜才可以吹奏的，而萧的结构则不需要膜，可直接吹奏。

2、现在流行的两者也有区别，现在市面上流行的笛子多是6孔笛子，而萧则有6、7、8孔萧，本人用的是8孔的。

3、两者的音质有很大区别，笛子声音清脆悦耳，萧的声音则相对来说要低沉浑厚一些。

4、哈哈，最为明显的就是，萧明显比笛子要长很多嘛。

学习的话，其实中国的管乐器都有一些共通之处，往往是学会了这个再学那个便方便许多了，我最开始学的是箫，所以后来笛子的时候要方便一些

了，相对来说，箫对我要简单一些。你的话还是看你比较喜欢哪个就学哪个吧，不过现在笛子要比萧流行很多，用到的机会也更多一些。