两地距离249公里。

根据查询百度地图显示，从宿迁市到南京市全程距离249公里，自驾大约需要2小时47分钟，路线为：从宿迁市出发，途经新扬高速、长深高速等，然后左前方行驶，进入红山快速路，行驶2.3公里，直行，进入龙蟠路，行驶2.5公里，直行，进入北京东路，行驶1.2公里，即可到达南京市。