青海医学院成立于1958年，它不是一所民办学院，而是国家举办的普通高等医学院校，现为青海大学医学部，成为青海省唯一一所普通高等医学院校。

在2004年11月，青海医学院与青海大学整合组建新的青海大学，发展成为一个集本科生教育、研究生教育、留学生教育、普通教育、成人教育、继续教育为一体的办学格局，包含多层次、多形式的教育。

医学部的教育结构包括3个教学区（校本部学区、昆仑路学区、园树巷学区），涵盖了临床医学院、中医系、公共卫生系、药学系、基础医学部、高原医学研究中心、现代教育技术中心、图书馆和成人教育学院等。

目前，医学部设有3个一级博士学位授予权点，4个一级学科硕士学位授予权点，以及12个本专科专业。同时，拥有11门省级精品课程，中医和临床专业被列为省级一流专业，10门省级重点课程。

其中，高原医学被列为国家级重点学科，并作为学院的特色学科。医学部拥有1个国家级重点学科，2个国家级教学团队（含藏医），2个国家级特色专业建设点，1个国家级实验教学示范中心，4个省级重点学科；还有一所教育部重点实验室，6个省级重点实验室，3个省级实验教学示范中心（含藏医），3个省级“人才小高地”建设项目。

医学部现有临床教学基地26所，为学生提供了丰富的实践机会。