济宁学院确实是一个不错的选择，因为它是一所本科院校，同时也是公办的，这在很大程度上保证了教育质量。此外，济宁学院的学费相对较低，这对于家庭经济条件一般的学生来说，无疑是一个好消息。

相比之下，菏泽学院虽然在专科层面也有其优势，但与本科院校相比，还是存在一定的差距。这种差距主要体现在升学、就业及职业发展等方面。例如，在公务员考试、事业单位招聘以及职称评定等方面，本科毕业生通常会拥有更多的机会和优势。

对于想要继续深造的学生来说，如果选择菏泽学院的专科，那么在完成专科学习后，还需要额外花费一年的时间来参加专升本考试，以期进入本科阶段的学习。然而，通过这种方式进入本科阶段，不仅需要面临更大的竞争压力，还需要付出更多的时间和精力。

因此，如果条件允许，还是建议优先选择本科院校。当然，对于一些特殊原因导致无法选择本科的学生而言，专升本依然是一个不错的选择，但无论如何，都应该将提升学历作为长远目标，努力实现个人价值的提升。