重庆北部新区地方税务局机构设置中，办公室承担着综合文件起草、审核印发、会务支持、秘书事务、议案提案处理、公文管理、内外协调、接待、督办督查、税收宣传、保密安全、物资采购、财务管理、经济税源调查、税收计划编制等工作。

人教科负责人事管理、编制、机构设置、工资福利等，包括干部晋升、考核、教育培训、文明创建、离退休人员管理及党群协调，部分内部财务审计任务。

计财科主要负责年度税收计划的编制与分配，监督税款缴退，进行税收分析预测和企业税收调查，执行财务会计核算制度，管理预算决算，资产管理及国库支付等工作。

征管科负责依法行政、税收政策落实、重大案件审理、税收执法监督，以及税务登记、纳税申报、发票管理、税控器具推广等征管具体实施。

税政科负责税费法律宣传、政策落实、审核减免退税、涉外税收管理、社会保险费管理、税源分析与指导，以及综合性税收征收管理工作。

稽查局负责组织协调税务检查、案件查处、违法案件处理、与司法机关的协调，以及重大税务案件的审理和公告等工作。

税务所如鸳鸯、人和、龙头寺和大竹林税务所，执行国家法规，负责纳税人的税务登记、发票管理、申报征收、日常检查、税源管理、税收宣传和辅导等地方税收征收工作。

办税服务厅则直接面向纳税人，处理登记、申报、税收政策咨询等服务工作。