一级建造师初始注册和转注的主要区别在于注册特点、注册时间和申请材料的不同。初始注册指的是考生拿到一级建造师执业资格证书后，第一次注册在某个单位，而转注则是在劳动合同终止后，在另一个单位注册。

在时间上，初始注册比转注要花费更长的时间。考生进行初始注册时，至少需要两个月的时间才能完成整个注册流程。这是因为注册需要层层上报和审批，同时与考生所在单位的上报机构数量有关，如果省属单位上报的机构较少，则审批会更快。而转注通常在半个月内就能完成。

在申请材料上，转注和初始注册大多材料相同，但转注还需要准备提交注册建造师变更注册申请表，以及申请人与新单位签订的聘用合同。转注持证人需要准备的材料还包括申请表、三方协议以及解聘证明等，然后将这些材料提交给新单位，让新单位带着材料去当地建设厅注册审核，审核通过后还需要经过公示。

总的来说，初始注册和转注在注册特点、注册时间和申请材料上存在明显的差异。考生在进行注册时，需要根据实际情况选择相应的注册方式，并准备好相应的材料。