预付款回扣是指发包人在支付给承包人的工程备料款中，随着工程进度的推进，逐步扣除已使用的主要材料及构件费用的过程。备料款的性质为“预支”，当工程所需材料和构件用量减少时，原支付的预付款应逐步扣回。

确定起扣点是工程预付款回扣的关键，其依据是未完施工工程所需主要材料和构件的费用等于预付备料款的数额。起扣点的计算公式为：T＝P－M/N，其中T代表起扣点，即预付备料款开始扣回的累计完成工作量金额；M代表预付备料款数额；N代表主要材料、构件所占比重；P代表承包工程价款总额。

例如，某项工程合同价为100万，预付备料款数额为24万，主要材料、构件所占比重为60%，则起扣点为多少万元？根据公式：T＝P－M/N＝100-24/60%＝60万元，当工程量完成60万元时，本项工程预付款开始起扣。

在实际工作中，工程备料款的回扣方法可由发包人和承包人通过洽商用合同的形式确定，也可针对工程实际情况具体处理。对于工期较短、造价较低的工程，无需分期扣还；对于工期较长的跨年度工程，备料款的占用时间较长，根据需要可以少扣或不扣。

在国际工程承包中，FIDIC施工合同对工程预付款回扣也有规定，其方法比较简单，一般当工程进度款累计金额超过合同价格的10%~20%时开始起扣，每月从支付给承包人的工程款内按预付款占合同总价的同一百分比扣回。

在某些情况下，发包人和承包人还可以根据工程实际情况，对工程预付款回扣的具体方法进行协商，以更好地满足工程的实际需求。

工程预付款回扣的实施，有助于平衡发包人和承包人的资金需求，确保工程进度的顺利进行，同时也能够减少资金占用，提高资金使用效率。

总之，工程预付款回扣是一种科学的资金管理方法，其实施需要根据工程的具体情况，结合发包人和承包人的实际需求，灵活运用。