中国科学院下属8个计算研究机构，如计算所、软件所、网络中心等，专注于计算机科学的研究，自动化所涉及AI和应用领域，数学所着重AI与数据库研究，成都计算所主要聚焦应用研究，沈阳自动化所亦有AI与机器人研究，沈阳计算所实力相对较弱。其他研究所如电子所、声学所、高能所等，也在CS领域内有研究组。

国内约30所研究型大学和机构，如中国科学院的研究机构，持续开展CS研究工作，能通过各类渠道筹集经费维持运作。这些机构除个别外，基本符合研究机构的定义。

计算理论是CS中最基础的方向，研究可计算性、复杂性等，涉及数学模型，有唐稚松、陶仁骥等知名学者。数学背景的学生，对计算本质有热情，且数学能力强，可以选择此方向。导师如软件所的陶仁骥、数学所的金芝、计算所的眭跃飞等值得关注。

AI方向理论性强，数学要求高，有机会构建实际系统。机器定理证明和自然语言理解是研究热点，如吴文俊、高小山、张景中等的研究。导师包括计算所的史忠植、白硕，数学所的陆汝钤。机器人和计算机视觉虽归AI大类，但性质差异较大。

计算机架构领域，国内主要精英集中在高性能计算机基地，如计算所的曙光、国防科大的银河、总参56所的神威等。导师如夏培肃、李国杰、韩承德、闵应骅等，重要研究组包括计算所的徐志伟组。并行算法研究分到了软件所。

系统软件方向有生机，open source运动带来了机遇，导师主要负责管理而非技术指导。计算所的徐志伟、软件所的孙玉芳等研究组从事Linux增值开发。编程语言系统方面，计算所的张昭庆研究组较为活跃。

数据库研究以人大为首，中科院的数学所和软件所也有研究，侧重于工程实践而非理论探索。

网络研究在国内实力较强，传统研究涉及网络协议，如李忠诚、钱华林、阎保平等，网络中心有最佳实验环境。安全方向受重视，软件所的冯登国研究员在信息安全研究领域有突出贡献。

多媒体研究聚焦编码、解码、压缩、传送，软件所与贝尔实验室合作，高文曾是这一领域的领军人物。

计算机图形学方面，软件所的吴恩华研究员是关键人物，研究科学计算可视化。计算机视觉与机器人领域，中国有微软亚洲研究院的顶尖水平，自动化所研究实力突出，谭铁牛研究员是明星学者。