通过NADH呼吸链最终与氧气结合生成水，伴随有2.5摩尔的ATP生成。

这一过程涉及从NADH到O2的电子传递，以及通过ATP合酶将ADP转化为ATP。具体来说，NADH通过一系列的电子传递步骤将其电子传递给O2，在此过程中释放的能量被用于合成ATP。

相比之下，通过FADH2呼吸链最终与氧气结合生成水的过程则更为复杂。它涉及从FADH2到O2的电子传递，以及通过复合体Ⅲ和Ⅳ的一系列化学反应。这个过程通常伴随着1.5摩尔ATP的生成。

总的来说，虽然这两种呼吸链在电子传递和能量生成方面有所不同，但它们都涉及到电子从还原当量较低的化合物（NADH或FADH2）传递到O2的过程，并生成ATP以存储能量。

NADH呼吸链与ATP合成酶的关系：

NADH呼吸链与ATP合成酶之间存在密切的关系。NADH呼吸链是细胞内的一种电子传递链，它能够将NADH中的电子传递给氧气，同时产生能量。这个过程中产生的能量被ATP合成酶利用，将ADP转化为ATP，从而储存能量。

NADH呼吸链和ATP合成酶在能量代谢过程中起着相互协作的作用。NADH呼吸链产生的能量为ATP合成提供了动力，而ATP合成酶则利用这些能量将ADP转化成ATP，以满足细胞的各种能量需求。

除了相互协作，NADH呼吸链和ATP合成酶还在细胞呼吸过程中保持一定的调控平衡。当NADH的浓度较高时，NADH呼吸链的活性增加，促进电子的传递和能量的生成。这将提供更多的能量给ATP合成酶，使其能够将更多的ADP转化为ATP。这种调控平衡确保了细胞内的能量供应和需求的匹配。