农村自建三层楼房的造价因地区、材料、设计和细节等因素而异，一般来说，造价在每平米1000元至2000元之间。具体的数字还需要根据实际情况进一步确认。以下是一些详细的解释供您参考。

一、基础造价：三层楼房的基础必须稳固，通常涉及挖掘、混凝土浇筑等工作，这部分的费用会因地质条件和房屋大小而有所不同。地基越复杂，造价越高。此外，地下部分如地下室或地下室墙体的防水处理等也会影响造价。基础部分大约占据整个造价的百分之二十至三十左右。具体到农村地区可能涉及聘请专业打桩队伍的费用，价格因地而异。

二、主体结构造价：主体结构包括墙体、楼板、屋顶等部分。这部分造价与选用的建材有很大关系，如混凝土、砖等材料的价格直接影响最终成本。三层楼房的主体结构造价通常会占据总造价的较大比重。另外，结构设计的复杂性也会对造价产生影响。在农村自建房过程中，选择合格的施工队伍也非常关键，他们的施工效率和质量直接影响整体造价。

三、装修及配套费用：除了基础与主体结构外，装修及配套费用也是不可忽视的部分。这部分包括内外墙涂料或瓷砖、门窗安装、水电线路铺设等费用。这部分的费用会因装修的档次和材料选择差异较大。在农村自建三层楼房中，可以根据自身需求和预算进行适当的选择和调整。

综上所述，农村自建三层楼房的造价涉及多个方面，需要根据实际情况进行估算。建议在建造前进行详细规划和预算，以确保整个项目的顺利进行和完成。如需准确预算，建议咨询当地的建筑公司或相关机构获取更详细的报价信息。