赣南卫生健康职业学院的学费标准为5000元/学年，住宿费用则根据不同的宿舍条件有所差异，大致在500至800元/学年之间。

为了激励优秀学生并帮助那些经济条件较为困难的学生顺利完成学业，学院设立了多项奖学金制度。其中包括国家奖学金，每年每位获奖者可获得8000元奖金；国家励志奖学金，每位获奖者每年可以获得5000元奖金；此外还有学校自主设立的优秀学生奖学金、三好学生以及优秀学生干部等奖项。

所有获奖学生除了会获得相应的奖金外，还会获得荣誉证书，并将其记录在个人档案中，以便未来升学或就业时作为参考。