赣州市城乡规划建设局内设机构，根据职能分工，主要分为以下几个部门：

党政办公室：负责机关日常运转工作，包括信息、安全、保密、文件管理、对外联络、政务公开、人大代表建议与政协委员提案办理等。

政策法规科（信访室、综合治理办公室）：负责政策调研与改革方案拟定，行业依法治业工作，组织行业政策文件起草、初审与报批，法制宣传，行政执法监察，信访与社会治安综合治理。

城乡规划技术科（总规划师办公室）：负责城乡规划事业中长期规划制定，城市规划编制指导与评审，市域城镇体系、中心城区总体规划与控制性详细规划编制，专业规划指导与调整修编，土地利用总体规划审查，重大项目的选址，历史文化名城与风景名胜区管理，规划设计市场协调与管理，规划技术交流。

建筑工程规划管理科：负责中心城区建设用地与建设工程规划管理，城市雕塑与户外广告规划，城市地下空间利用工程规划管理，项目复审、技术和政策把关，项目用地规划条件出具，项目选址、总平面图与用地规划条件审查，建筑项目批后监管与规划验收，旧城改造与重要地段综合整治，规划业务档案管理。

市政工程规划管理科：负责中心城区市政工程建设项目规划与管理工作，城市勘察、市政工程测量，测绘成果监督与管理，市政工程项目规划许可与批后监管，市域重大市政建设项目的规划选址，综合管线普查与管理工作。

城市建设科（新型城镇化工作领导小组办公室）：研究城市建设发展战略与中长期规划，指导县市城市建设与管理工作，城市供水、排水、燃气行业管理与安全生产指导，城市污水处理设施配套建设，园林、市政企业资质审核，城市建设行业统计，中心城区排水许可审批与设施使用费征收，新型城镇化领导小组办公室日常工作。

村镇规划建设科（小城镇建设办公室）：研究村庄与小城镇建设政策与发展战略，指导镇乡村庄建设规划与实施，村镇建设管理工作，重点镇、示范镇建设，农村住房、危房改造、住宅设计图推广，历史文化名镇（村）保护与管理，村镇规划管理人才培训，个体建筑工匠从业资格管理。

建筑业管理科（总工程师办公室）：制定建筑业发展规划，规范建筑与监理市场，指导建筑装饰行业，工程质量、合同管理、工程风险，招标代理、工程质量检测管理，施工现场预拌混凝土与砂浆管理，建筑安全生产与竣工验收备案，重大工程质量事故调查，建筑企业对外工程承包，施工许可证审核，清理建设领域拖欠农民工工资。

勘察设计科（工程抗震办公室、建筑节能科）：制定勘察设计咨询业发展规划，规范市场，监督管理勘察设计质量，工程建设标准审定与推广，勘察设计单位资质与执业资格管理，施工图审备案与行业自律监督，建筑智能化、造价咨询管理，工程抗震与建筑节能监督管理。

市政项目管理科：负责编制中心城区市政基础设施建设项目中长期规划与年度实施计划，项目计划目标考核与协调推进。

财务审计科：执行财经政策与规章制度，财务管理办法制定与实施，全局年度预算与决算编制与审核，内部审计，国有资产与资金管理，局属单位财务协调，基建项目与技改计划审核，财务档案管理，招商引资与专项经费管理。

人事教育科：负责机构编制管理、人事调配、工资社会保障、档案与科级干部选拔考察，规划建设行业人才发展计划与培训实施，全系统干部职工继续教育、培训、职称与职业技能鉴定、成人教育管理，机关离退休人员管理。

行政审批服务科：负责局行政审批与非行政许可事项的具体审批与服务工作，受理行政许可申请与送达决定，其他审批事项转办与联络。

机关党总支：负责机关与直属单位党务工作，精神文明建设与对外宣传，工、青、妇等群团指导。

纪检组（监察室）：为市纪委（市监察局）的派驻机构，负责纪检监察工作。