驻马店高新区辖4个办事处、1个乡：金河、金山、金桥、开源办事处、关王庙乡。区管理委员会驻金河办事处。根据查询驻马店市官网信息显示，高新区分南中北三区，面积近百平方公里。南区以发展工业园区为主，中区是科教、商贸园区，北区以高新技术园区、高效农业园区为主，在此基础上规划的五大专业园区建设已初具规模。其中，金桥工业园位于高新区南区，是高新区起步发展的基地。科教园区地处中区，汇集了市区十余所大中专院校和科研机构，是驻马店市的智力密集区。高新技术园区位于中区，以从事电子电气、生物医药研究、开发和生产为主。关王庙民营工业城是高新区新规划的又一工业园区，位于高新区北区，按照高标准、高科技、高品位、高效益的理念规划建设，将成为高新区的又一发展亮点。小清河农业观光园位于高新区北区，是驻马店市近郊旅游的亮点景观，以发展精品农业、观光农业和休闲服务业为主。