南京考研机构有：

1. 南京新东方考研机构

2. 南京文都考研培训机构

3. 南京启航考研辅导机构

4. 南京天道考研集训营

详细解释如下：

南京新东方考研机构：这是新东方教育科技集团旗下的一家专业考研培训机构，拥有多年的教学经验，提供全面的考研辅导课程，包括政治、英语、专业课等，帮助考生系统备考，提高考研成功率。

南京文都考研培训机构：文都教育在南京设有分支机构，专注于考研培训。该机构提供全方位的考研辅导服务，包括线上和线下课程，针对不同类型的考生提供个性化的辅导方案。

南京启航考研辅导机构：启航考研是一家专注于研究生考试的培训机构，提供全方位的备考指导和辅导服务。其特色是结合考生的实际情况，制定个性化的学习计划，帮助考生高效备考。

南京天道考研集训营：天道教育同样在南京设有考研集训营，提供专业的考研培训和辅导。该机构注重考生的全面素质提升，除了提供考试科目的辅导外，还注重培养考生的学习能力和应试技巧。

以上几家机构都是在南京地区具有较高知名度和影响力的考研培训机构，考生可以根据自己的需求和实际情况选择合适的机构进行备考。