陕西医学高等专科学校于2006年2月得到了国家教育部的认可，升级为医学本科教育机构，更名为西安医学院，这所院校被归类为二本本科的公办学校。

西安医学高等专科学校则是由国家教育部批准并由陕西省教育厅管理的全日制普通高等专科学校，它属于高职大专层次的民办院校。

从办学性质来看，西安医学院作为公办学校，可能在师资力量、教学资源和就业支持方面更具优势。而西安医学高等专科学校作为民办院校，可能在灵活性和个性化服务方面做得更好。

具体选择哪所学校，取决于学生个人的职业规划和经济条件。如果追求更好的资源和支持，西安医学院可能是更好的选择。如果更看重灵活性和个性化服务，西安医学高等专科学校则可能更适合。

此外，两所学校在专业设置、教学质量、毕业生就业等方面都有各自的特色和优势。建议考生和家长在做决定前，深入了解两所学校的具体情况，包括师资力量、课程设置、实训条件、实习就业机会等。

同时，也可以参考其他学生和家长的评价和反馈，以便做出更明智的选择。

总体而言，陕西医学高等专科学校和西安医学高等专科学校各有特点，学生和家长在选择时需要根据个人需求和实际情况进行综合考量。