在选择南京航空航天大学和合肥工业大学时，南京航空航天大学无疑更具吸引力。南京航空航天大学作为部属211高校，其知名度和影响力相对更大，这主要得益于其卓越的教学质量和科研水平。相较于合肥，南京作为省会城市，拥有更加优越的地理位置和更为丰富的教育资源。

南京航空航天大学的学科设置全面，涵盖了航空宇航科学与技术、电子信息工程、机械工程等多个领域。这些学科不仅在国内享有盛誉，在国际上也具有较高的认可度。而合肥工业大学虽然同样为部属211高校，但在知名度上稍逊一筹。尽管该校在工科领域的研究实力不容小觑，但在某些特定领域，如航空和航天工程，南京航空航天大学则更胜一筹。

此外，南京航空航天大学的就业前景也更为广阔。南京作为东部发达城市之一，吸引了众多企业在此设立研发中心和分支机构。毕业生在这里可以接触到更前沿的技术和更广阔的发展平台。而合肥，虽然近年来发展迅速，但在就业机会和资源上仍不及南京。

当然，选择哪所学校还应考虑个人兴趣和职业规划。如果你对航空和航天领域有浓厚的兴趣，南京航空航天大学无疑是一个不错的选择。而如果你更倾向于机械工程、电子信息等工科专业，合肥工业大学也是一个值得考虑的选项。

总的来说，南京航空航天大学在知名度、学科设置和就业前景方面都更具优势。但选择学校最终还是取决于个人的兴趣和职业规划，希望每位学生都能做出最适合自己的选择。