永州市的交通运输工作机构隶属于永州市人民政府，作为其重要组成部分。该局设有多个专门的科室，包括办公室、政工科、财务（审计）科、计划基建科（交战办）、安全法制科、运输综合科（科技）、纪检监察室、城市客运科等，共计八个职能科室。在下属单位中，拥有一个正处级单位——永州市汽车运输总公司，四个副处级单位如永州市道路运输管理处、永州市地方海事局等，以及三个正科级单位，如永州市交通勘察设计院和永州市城市客运管理办等。

截至2011年底，永州市的公路网络十分发达，总里程达到了2.21万公里。其中高速公路179公里，国省干线公路1068公里，农村公路更是达到18927公里，实现了乡镇通沥清或水泥路100%覆盖率，行政村的通达率和通畅率分别达到100%和83.4%。公路密度高达98.53公里每百平方公里，二级及以上公路占比为3.64%。境内重要的水运通道是湘江和潇水，航道总长度为545公里，其中等级航道占150公里。

在交通运载工具方面，永州市拥有货运车辆39882辆，客运车辆3904辆，运营的客运线路多达1043条，日均运送旅客数量为15万人次。同时，全市设有21个三级以上车站，为旅客提供了便捷的服务。在水运方面，共有各类船舶1546艘，总吨位达到4.7万吨，载重吨位为3.9万吨，客位数为16549个，显示出永州市强大的水上运输能力。