南京的五加二学校分布在江宁大学城与江宁开发区，其中大学城汇集了南京医科大学、金陵科技学院、中国药科大学、南京工程学院、中国传媒大学南广学院、江苏海事职业技术学院、南京晓庄学院、南京交通职业技术学院、江苏经贸职业技术学院与江宁职教中心，还有金陵协和神学院。而江宁开发区则集中了南京航空航天大学、河海大学、正德学院、东南大学、金城学院。