卫生局与药监局分别管理药师资格证，两者存在区别。

卫生局仅认可卫生厅颁发的药师资格证，而药监局则只承认其自身颁发的药师资格证。

药监局从前隶属于卫生厅，后独立成为单独部门，导致两者在药师证认证上形成分离。

若计划在医院工作，应考取卫生局的药师资格证；若目标为药品流通单位，如药店，药监局的药师资格证则更为适用。