重庆电子工程职业学院拥有多项重点建设专业。其中，信息安全技术、通信技术、微电子技术作为中央财政支持的重点，显示了学院在这些领域的实力与地位。汽车制造与装配技术、物流管理则是市财政支持的重点专业，体现了学院在汽车制造与物流管理领域的专业优势。电子声像技术被列为国家教改试点专业，而通信技术、计算机网络技术更是成为重庆市高职教育示范专业，显示出学院在信息技术教育方面的卓越表现。会计电算化、国际商务则是重庆市高职教育特色专业，彰显了学院在财经教育领域的独特魅力。

学院在课程建设和教材编纂方面也取得了显著成绩。《信息安全技术》、《JAVA程序设计》、《程序设计基础》、《数字电路》、《电路基础》、《电子商务管理》等6门课程被列为省级精品课程，而《现代通信原理》、《关系数据库与SQL Server2005》、《局域网组建与管理》、《管理会计》、《成本会计》等5种教材则成为普通高等教育“十一五”国家级规划教材，反映了学院在教育质量上的高标准。

学院还建成中央财政支持的电工电子与自动化、汽车维修技术职业教育实训基地，以及重庆市财政支持的数控技术职业教育实训基地，为学生提供了优质的实践学习环境。国家职业技能鉴定所的存在，进一步提升了学院的职业教育水平，学生可以在此进行44个工种的培训与职业资格鉴定。

学院构建了电子信息、通信工程、计算机应用、软件工程、机电工程、汽车工程、传媒艺术、会计与金融、工商管理、建筑与材料工程10个系，开设了与电子信息、汽车摩托车、装备制造等重庆支柱产业相适应的专业51个，全日制在校生人数达到18000多人，成为重庆市唯一超万人规模、校园面积逾千亩的高职“航空母舰”。学院不仅在规模上独占鳌头，更是重庆高等职业教育的一张闪亮名片。