1991年至2001年，湖沟中学经历了快速发展。学校秉持“扎实办教育，开拓进取”的办学理念，逐步构建起“团结、务实、开拓、进取”的校风和“严谨、爱生、敬业、奉献”的教风，以及“立志、勤奋、尊师、守纪”的学风。学校在这一阶段形成了良好的治学风气和办学环境。1994年，学校建成了首座教学楼，1998年，首座学生宿舍楼也相继落成，使得学校占地面积达到10604平方米，班级数量增至32个，学生总数达到2854人，教职工队伍也得到了壮大，人数增加到140人。在这11年间，学校共向高校输送本科生246人，专科生714人，中专生123人。

1990年9月至1992年4月，王先立担任校长，单乃曾担任教务主任，岳民担任政教主任，周岭贤担任总务副主任。1992年5月至1994年3月，马万里接任校长，王绪龙担任副校长兼教务主任，单乃曾继续担任政教处主任，黄忠从官沟中学调任总务主任。1994年4月至1995年4月，王绪龙副校长主持工作。1995年5月至2001年9月，王绪龙担任校长。李良文（兼教务主任）、陈彪、张同锦担任副校长，政教处主任陈彪、汤敬国，总务主任黄忠。董金良、马文惠、于邦友、孙强任教务副主任。任广济任保卫股长，单亮任团委书记。

2009年9月25日，湖沟中学迎来了60周年校庆，学校举办了一系列庆祝活动。60周年校庆标志着湖沟中学在新的历史阶段上的启航，是学校汇聚智慧、再创辉煌的新起点，也是承前启后、继往开来的转折点。