① 产生不同；合同基于意思表示一致，指导基于主体“积极行政”；

②作用不同，合同为实现特定目的而与相对人订立合同，指导是主体管理的行为；

③ 性质不同，合同是双方的法律行为，指导是单方行为；

④ 效力不同，合同有实际效力，指导不产生强制力；

⑤ 行政主体在行政合同中有对相对人不符合合同行为的制裁权利，而行政指导中不能制裁相对人。

以上来自个人总结，不代表西法大观点。