学院拥有基础医学一级学科博士学位授予权、基础医学博士后流动站、国家“985工程”和“211工程”重点建设项目、2个省级重点学科（基础医学一级、药理学二级），1门国家级双语教学示范课程（医学免疫学），1个国家级教学团队（医学机能实验学教学团队），2门国家级来华留学英语授课品牌课程（局部解剖学、医学免疫学），5门省级精品课程（药理学、人体解剖学、病理生理学、人体寄生虫学和医学免疫学），1个省级实验教学示范中心，2个省级重点实验室（过敏及免疫相关疾病湖北省重点实验室、发育源性疾病湖北省重点实验室）。
学院病原生物学系和免疫学系为武汉大学病毒学国家重点实验室的重要组成部分。近年来获卫生部全国优秀教材一等奖1项，主编国家级“十二五”规划教材1部。