烟台的高等教育机构种类繁多，涵盖了本科、专科等不同层次。本科类院校中，烟台大学、鲁东大学（原烟台师范学院）、山东工商学院以及滨州医学院（通常被称为滨州医学院烟台校区）是烟台市的四所公办本科院校。除了这四所公办院校，烟台还有三所民办本科院校：烟台大学文经学院（位于莱山）、烟台南山学院（位于龙口）、以及青岛农业大学海都学院（位于莱阳，实际上这是青岛农业大学的莱阳校区，前身是莱阳农学院）。

在军校方面，海军航空大学是烟台的重要教育机构之一，其本部位于烟台，在全国多地设有飞行训练基地。此外，中国农业大学和哈尔滨工程大学正在建设研究院。

专科类院校方面，烟台的职业教育机构同样丰富。其中，山东中医药高等专科学校属于高专类院校，烟台职业学院、烟台工程职业技术学院、烟台汽车工程职业学院、山东商务职业学院和烟台黄金职业学院（这两所为民办院校）则是高职类院校的代表。此外，还有来自其他高校的研究院或研究中心，如吉林大学、西北大学、同济大学、山东建筑大学、青岛科技大学、上海交通大学、北京科技大学和天津工业大学等院校的研究院或研究中心。

值得一提的是，烟台曾计划引进一所名为烟台格罗宁根大学的院校，但因为格罗宁根大学的提案未能获得荷兰政府的批准，导致该项目未能实现。