工程审计主要分为两种类型：工程造价审计和竣工财务决算审计。

工程造价审计涉及对单项或单位工程的成本进行审核。审计过程与乙方的决算编制过程类似，依据工程量和定额进行。这项工作通常由造价工程师负责。

对于建设单位而言，虽然工程造价审计能够审核单项或单位工程的合同成本，但整个项目的总支出不仅仅包括这些，还包括前期开发费用、工程管理杂费等。因此，还需要进行竣工财务决算审计。这种审计会将造价工程师已审核的成本与未经过造价工程师审核的所有支出汇总起来，审查是否有不合理支出，是否存在挤占建设成本或计划外建设项目的情况。

竣工财务决算审计由注册会计师执行。这项审计的目的在于确保所有支出的合理性，避免不必要的浪费，最终确定项目的总造价。

通过这两种审计方式，建设单位可以全面了解项目的财务状况，确保资金使用的透明度和合理性。