网络工程师的主要课程分为四个阶段，包含多门核心科目。在第一阶段，基础学习内容包括计算机操作基础，Office办公自动化，计算机组装与维护，TCP/IP技术精讲以及网络设备调试，并且在这一阶段还设有职业素养课，旨在培养良好的习惯和教育。

第二阶段课程内容则更为深入，主要涉及WindowsServer系统管理，WindowsServer服务器配置，Linux系统管理和SHELL脚本编程，Linux服务器配置与应用，SQLServer数据库管理与应用，以及Python网络编程。

第三阶段重点在于网络设备与网络设计（CCNA），IPV6及无线网络技术，网络安全，黑客攻防技术，结构化综合布线，Linux服务器操作系统，以及SQLServer数据库设计查询。

最终的第四阶段课程则主要针对企业网安全管理（硬件防火墙），高级路由和交换技术（CCNP），云计算、云存储技术以及毕业综合实训，这些课程旨在培养高级网络工程师，提升解决实际问题的能力。