二级建造师的执业印章丢失后是可以申请补办的。首先，你需要前往当地建设委员会（建委）申请补办印章。补办流程完成后，你才能进行转注操作。建议你在补办的同时，重新刻制一个和原印章样式完全一致的印章。这是因为，当你进行注册中心的转注时，他们通常不会严格审查印章的真实性，因此按照原样刻制印章可以简化整个手续过程。

补办印章的具体流程可能因地区不同而有所差异，建议你提前咨询当地建设委员会的具体要求。一般而言，你需要准备的材料包括身份证明、执业资格证书、近期照片等。提交材料后，建设委员会会进行审核，并在审核通过后为你补发新的印章。

重新刻制印章时，务必确保新印章的样式、尺寸、材质等都与原印章完全一致，以避免在转注过程中遇到不必要的麻烦。此外，一些地区可能会有特定的印章制作标准和要求，因此在刻制新印章之前，最好先与当地建设委员会进行沟通确认。

需要注意的是，虽然注册中心在转注时不会严格审核印章的真实性，但这并不意味着你可以随意伪造或使用他人印章。务必遵守相关法律法规，确保印章的真实性和合法性。

总之，二级建造师的印章丢失后可以申请补办，但你需要按照正确的流程进行操作，并确保新印章与原印章完全一致。这不仅能简化转注手续，还能确保你的执业资格不受影响。