要将日文网站的所有内容翻译成中文，主要可以通过两种方式实现：手动翻译和自动翻译。

手动翻译需要人工进行，这通常需要翻译者具备较高的日语和中文水平，以及对两国文化的深入理解。这种方式的翻译准确性较高，可以更好地传达原文的含义，但效率相对较低，需要投入大量的人力和时间。

自动翻译则通过机器学习等技术进行，可以快速地翻译大量的文本内容。然而，自动翻译的准确性可能不如手动翻译，尤其是在处理复杂的语言结构和语境时。

具体操作上，如果选择手动翻译，可以首先复制日文网站的内容，然后通过翻译软件或在线翻译工具进行逐句或逐段的翻译。翻译完成后，需要对译文进行检查和修改，以确保翻译的准确性和流畅性。

如果选择自动翻译，可以使用各种翻译插件或浏览器扩展程序，这些工具可以自动检测网页内容并翻译成所需的语言。但是，由于自动翻译的局限性，翻译完成后仍需要检查和修正可能出现的错误。

总的来说，选择哪种翻译方式需要根据实际情况和需求来决定。如果注重翻译的准确性和流畅性，且时间和人力充足，可以选择手动翻译。如果需要快速获取大致的翻译内容，则可以选择自动翻译。无论选择哪种方式，都需要对翻译的内容进行后续的检查和修正，以确保翻译的质量。