会计电算化业务信息设置操作流程主要包括账套的创建与权限分配、凭证类别的设置、会计科目的增加及期初余额的录入与试算平衡，以及记账凭证的填制、审核、记账和财务报表的编制与提交等环节。具体步骤如下：

首先，新建账套。在“系统管理”中，通过“账套—建立”创建账套，输入账套名称、单位名称等信息，选择核算类型、基础信息、分类编码方案等，设定数据精度，启用账套时只需启用总账即可。

其次，赋予操作员权限。在“权限—权限”中，设置两个操作员为账套主管，并确保他们能够使用该账套。

接着，设置凭证类别。在“基础设置—财务—凭证类别”中，选择默认的“记账凭证”。

然后，增加会计科目。在“基础设置—财务—会计科目”中，录入科目代码和名称，特别注意科目编码需为4位数，如1001现金。

接下来，录入期初余额并试算平衡。在“总账—设置—期初余额”中，录入各科目的期初余额，并进行试算平衡。

之后，填制记账凭证。在“总账—凭证—填制凭证”中，根据实际业务情况录入凭证信息，注意摘要、金额等关键字段的准确性。

再后，审核和记账。更换操作员身份，审核凭证，确保凭证无误后进行记账。

最后，编制并提交财务报表。在“财务报表”中，选择合适的报表模板，录入关键字并计算报表，提交当前报表。

特别需要注意的是，在报表提交时应逐一提交，确保每个报表独立完整。完成资产负债表提交后，再进行利润表的编制与提交。

整个过程中，确保操作的准确性和完整性，避免因操作错误导致的数据不一致或报表提交失败。